在实际手术过程中，医生发现，由于肿瘤挤压，眶部和前额部已经严重变形，手术切除后与预想切除部分并不完全一致，钛合金颅骨放上去与剩余颅骨不能吻合。樊丰势表示，这时软硬度结合的钛合金发挥了作用，经过细致修补，医务人员最终将前半个人工颅骨和后半个人工颅骨与患者剩余颅骨完美吻合。
然而，新的困难再次出现。由于国内外没有先例可资借鉴，之前并没考虑到经过肿瘤长期内外挤压，颅骨内部的脑子向一侧偏斜，并且不在通常的正位，而钛合金颅骨塑形时并没将这一因素考虑进去。
樊丰势说，这一问题为钛合金颅骨安装带来风险——— 如果按照原来预想的正位塑形进行安装，脑子和钛合金颅骨间会产生很大的间隙，容易形成外科忌讳的“死腔”，形成顽固性术野积液积血、细菌感染，甚至导致脑子化脓感染、手术彻底失败等后果。而如果按照新的形状修复钛合金颅骨，又会形成明显头颅畸形，影响美观。“最终，为了保证外观美观，我们维持了钛合金颅骨原来的塑形。”樊丰势说，为防止死腔形成，尽量磨薄颅骨，减少间隙，同时利用自体脂肪添加可吸收性胶原蛋白海绵进行填塞，使间隙更小。如此，解除肿瘤压迫后，脑子会在纤维组织牵拉下逐渐复位。
经过对剩余颅骨和钛合金颅骨重新塑形，铆上14颗钛钉，金属颅骨被牢牢固定。
10个小时肿瘤切除，保护视神经、额神经、眼球等万无一失
“如此巨大的颅骨肿瘤，我从医30多年来从没见过。”樊丰势坦言。
李秋各入院时两个眼球向外凸，整个头颅明显增大，已经严重变形，而且头围要比正常人多出六七厘米，帽子根本戴不进去。看到这么大的颅骨肿瘤，樊丰势也吃惊不小，“更意外的是，颅骨的3/4都被肿瘤侵蚀，向前已经侵犯到眶腔和前额部，后边一直延伸到后枕部，压迫脑组织，如果病情进一步发展，会危及生命。”
樊丰势解释，骨纤维异常增殖一般在25岁以后就不再生长。但李秋各的已经转化为骨纤维瘤继续生长，尤其近3年生长迅速，导致颅内压升高以及眶内压升高，出现头痛以及眼球凸出。
根据两个部位的不同情况，医生决定肿瘤切除分为两部分进行，一部分是较为脆弱的前额部和眶部，另一部分是后枕部和颞顶部，后者相对较为简单。“为此，我们在手术时采用了冠状切口加辅助切口，也就是说共有两个刀口，一个是从右侧耳前一直切到左侧耳前，另一个再从头顶中部切到后枕部。”樊丰势介绍说，这样一方面可以照顾患者容貌美观，康复后伤疤会被头发挡住，不容易看出；另一方面还能使肿瘤部位充分暴露出来，不影响手术效果。
4月10日上午8时，患者被推进手术室，按照既定方案开始手术。全麻后，将患者的头固定好、头顶画线确定好需要切掉的肿瘤位置，医务人员开始使用手术刀、磨钻、铣刀、显微凿子等器械，一点点小心翼翼地进行剥离。“前额和眶部结构凹凸不平，肿瘤切除要求格外精细。”樊丰势说，甚至比打磨玉器还要严苛，因为一些神经或器官一旦破坏，便会对患者健康产生无法挽回的影响。“比如说，切除眉骨时，不能损伤从眉骨正中骨孔中穿过的额神经。”樊丰势解释，额神经只有我们平时吃的粉丝一样粗细，一旦碰到或扯断，就会导致患者前额失去感觉。为此，医生只能拿着不同型号的磨钻一点点把它磨开分离。
如此，仅切除前额部和眶部的肿瘤就用了6个多小时。14时许，经过一点点削磨，前半个头颅肿瘤终于被成功切除。18时许，后半部颅骨肿瘤也被成功切除。
